Tengo instalado MySQL5 y voy a acceder a través de mysqli por PHP5.

Mi duda es:

Por separación lógica, estoy desarrollando un proyecto que debiera usar
varias BD separadas, pero me preocupa que esto suponga menor rendimiento
, ya que lo tengo instalado en mi ordenador... y me gustaría que no se
colapsara. Si fuera así entonces tendría que poner todo en una única BD,
y sería un follón para mantenerlo dado el número de tablas y la
similitud que existiría entre el nombre de diversas tablas.

Gracias, y un saludo